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故事發生在被選召的孩子們首次接觸數碼世界的6年後。2005年的一天，東京港區海面上的波浪在朝陽下搖曳……17歲的高中生八神太一，如常地用手按停眼前的鬧鐘，踢開混亂的被鋪，低聲滴咕下伸展四肢。拉開了窗簾

太一等人因为狮子兽的死产生了动摇，而光子郎则提议找出缅因猫兽被感染的真相。但作为缅因猫兽主人的芽心却想不到为何缅因猫兽会被感染。为了防止其他数码宝贝被感染，光子郎在办公室建立了隔离区，然而巴达兽却已

一向我行我素，没有团体观念的青棒选手林啟明（李国毅饰演），最后一场争冠赛，又因为个人英雄主义作祟，让球队输了冠军战。不但因此被同儕排斥，回到家乡还成了公敌，被丢鸡蛋。而黯然去服役，当兵时又为了救一个新

在家长重重压力下想要离家出走的大雄（大原惠美 配音）、胖虎（木村昴 配音）、小夫（关智一 配音）和静香（嘉数由美 配音），在哆啦A梦（水田山葵 配音）的协助下来到了七万年前的地球。在创造属于自己的世外

小智（松本莉香 配音）来自真新镇，他的目标是要成为神奇宝贝顶级训练师。在即将展开训练师旅程的一天，因为迟到，他并没有拿到初始的小精灵。大木博士（石冢运昇 配音）见状，便送了一只不愿进精灵球和非常调皮的

某天，普通高中生永井圭（宫野真守 配音）在放学路上被卡车撞倒，短暂的死亡过后，他悠然回到人间。作为日本第三位亚人，永井被警察、亚人管理委员会乃至赏金猎人等多方势力盯上。与此同时，被亚人管理委员会称为“

“亚人”是1980年代开始渐渐出现在人类视野之中的新人种，他们源自于人类，有着和人类一样的外貌，却有着不老不死的肉身，只有一个人类死亡之后，才能够判断他是否为亚人。人类恐惧亚人身上所蕴藏的强大力量，对

西汉武帝年间，淮南王刘安崇尚仙法，广集豆类练取仙丹，仙丹未炼成，豆子却幻化为人形有了生命，成为了“豆族”。 主人公豆福和刘安一样痴迷于仙术，但是苦修多年也未能得道成仙。青梅竹马的豆香及志同道合的好友皆

缅因猫兽的暴走，以及由此引发的重启。留下苦恼的芽心，太一等人前往数码世界。重逢的搭档数码宝贝们，失去了至今为止的全部记忆。即使如此也为了再次筑起羁绊，而伸出手去的被选召的孩子们，与回应此的数码宝

《屠杀器官》的舞台将设定在赛拉耶佛核爆后的地球，此时部分落后国家爆发了一连串内战及民族冲突，在这血腥风暴之中，美国特殊情报部队「克拉维斯（クラヴィス）」发现了在阴影之下有一名叫「约翰?保罗（ジョン?ポ